ومن جانبه قال محمد البركاتي إنه من المؤكد أن جميع التراخيص والمخططات (الكروكي) الخاصة بمسجد الشجرة القديم (بيعة الرضوان) محفوظة في ملف كامل لدى أرشيف وكالة الأوقاف التي كانت تتبع سابقا لوزارة الحج والأوقاف (تتبع الآن لوزارة الشؤون الإسلامية والأوقاف)، وأنه من الممكن معرفة كل شيء عن مسجد الشجرة قبل وبعد إزالته في ملفات الوكالة.
اجتهدت «مكة» للحصول على أي معلومة بشأن ملف مسجد الشجرة في أرشيف وكالة الأوقاف.
ولم نحصل إلا على شهادة مصدر واحد، رفض الكشف عن هويته، يزعم فيها أن أحد أقاربه كان يعمل في وكالة الأوقاف، وأنه أبلغه بأن ملف وثائق وخرائط مسجد الشجرة تم سحبه من أرشيف الوكالة بعد تنفيذ أمر هدمه وإزالته، ولم يعد له وجود منذ ذلك الحين.
غير أنه لم يقدم دليلا ملموسا يؤكد ذلك غير شهادته الموثقة.